Описание исследования

Организм каждого человека представляет собой «плацдарм» для всякого рода микроорганизмов – бактерий, грибов, вирусов, которые образуют колонии на внутренних органах, слизистых оболочках и кожных покровах. Их совокупность получила название микробиом или микробиологический статус человека. Изучение его состояния является новым направлением в микробиологии. Исследования микробиома позволяют проводить диагностику инфекций, дисбиозов, воспалений. В их основе лежит изучение маркеров – специфических химических веществ, выделяемых микроорганизмами. Оно применимо для любых их групп.

От состояния микроэкологического статуса зависит функциональность органов и систем организма человека. Нормальная микрофлора имеет определенный состав и характерные особенности для каждого биотопа (локальной области обитания, однородной по абиотическим факторам среды). Она выступает в роли первичного защитного барьера организма, покрывая слизистые оболочки, кожу и кишечные стенки. Количество клеток микроорганизмов составляет порядка 10^9. В зависимости от воздействия на организм различных факторов, микрофлора претерпевает изменения, могущие повлечь за собой весьма неприятные последствия. Поэтому исследование состояния микробиома и восстановление нарушений в нем крайне важно́.

Основная часть микрофлоры человека обитает в кишечнике. Те факты, которые известны о совокупности населяющих его микроорганизмов (микробиоценозе), дают достаточно информации для понимания механизмов его функционирования. Однако этого недостаточно при таких нарушениях, как дисбиоз, требующих для диагностики и принятия решения о назначении терапии выяснения количественных и качественных изменений состава микрофлоры. Проявление дисбаланса могут иметь разные формы: расстройства кишечника, заболевания кожных покровов, нарушения функций половой системы, сердечных патологий и т.д.

Как уже отмечалось выше, новый метод диагностики основывается на изучении микробных маркеров – химических веществ, которые содержатся в стенках клеток микроорганизмов или являются продуктами их жизнедеятельности. Как правило, это разнообразные жирные кислоты, которые не содержатся в организме человека. Наличие достаточно чувствительного метода исследования – газовой хромотографии в сочетании с масс-спектрометрией (ГМ-МС), позволяет точно определить по масс-спектру химическую природу вещества. Для этого достаточно содержания его малых количеств в биологических жидкостях человеческого организма. При проведении анализа из них извлекаются высшие жирные кислоты, после чего они разделяются на хроматографе и анализируются на масс-спектометре. По полученным данным делается вывод о составе микрофлоры.

Преимущество данного метода исследования в возможности одновременного определения количественного состава большого ряда микроорганизмов. При этом не требуется предварительная их культивация и прочие дополнительные манипуляции – анализ проводится в режиме реального времени. Изменение количественных показателей позволяет наблюдать динамику изменения микрофлоры во время проведения терапии антибиотиками или пробиотиками.

Чувствительность данного метода исследования составляет 10^4 - 10^5 клеток в исследуемом образце, селективность анализа – до вида, если маркер имеется в наличии.

Подготовка к исследованию

Кровь

Анализ крови отбирается из вены. Материал желательно сдавать натощак.

Общие рекомендации:

• накануне исследования избегать физических и эмоциональных перегрузок;
• за сутки до обследования запрещен прием алкоголя, за час – курение;
• перед тестированием желательно временно прекратить прием всех препаратов (по согласованию с лечащим врачом);
• непосредственно перед сдачей крови желательно провести в спокойствии 10-15 минут.

Слюна

Материал собирается стерильный контейнер, который можно взять в пункте отбора пробы.

За полчаса до тестирования запрещается:

• есть;
• курить;
• чистить зубы;
• пить (исключение – простая вода).

В течение суток перед исследованием не употреблять спиртные напитки.

Материал необходимо доставить в пункт сбора в течение 5 часов. Если такой возможности нет, то слюну нужно заморозить в морозильной камере и доставить в замороженном состоянии.

Сперма

Образец материала собирается в стерильный пластиковый контейнер посредством мастурбации.

Моча

Перед сбором биоматериала необходимо:

• прекратить прием мочегонных средств;
• воздержаться от употребления фруктов и овощей, способных изменить цвет мочи;
• женщинам – не желательно отбирать пробу во время менструации.

Перед сбором мочи необходимо тщательно обмыть наружные половые органы.

Моча собирается сразу после утреннего пробуждения. Для этого используется пластиковый контейнер, который заполняется на треть сразу же, первой порцией. Остальная моча спускается в унитаз.

Материал необходимо доставить в пункт сбора в течение 5 часов. Если такой возможности нет, то мочу нужно заморозить в морозильной камере и доставить в замороженном состоянии.

Соскобы из мочеиспускательного и цервикального каналов

В цервикальном канале (канале шейки матки) материал отбирается в конце менструального цикла или в его начале, через 1-2 дня после окончания менструации.

Перед взятием соскоба запрещается:

• спринцевание;
• применение вагинальных мазей, свечей.

За 24-48 часов до отбора пробы необходимо воздержаться от половых актов.

Исследование не проводится после следующих процедур:

• мануальное исследование;
• инструментальное исследование;
• ультразвуковое исследование;
• кольпоскопия;
• биопсия и пр.

Соскоб из мочеиспускательного канала берется перед опорожнением мочевого пузыря или через 1,5-2 часа после естественного выделения мочи.

Показания к исследованию

Тестирование предназначено:

а) для исследования микробиома и выявления имеющихся в нем отклонений;

б) для определения или уточнения причин развития инфекционно-воспалительных процессов, затрагивающих любую область организма, излечением которых занимаются различные медицинские подразделения:

- в отделении реанимации и интенсивной терапии:

• при сепсисе;
• при образовании гнойно-воспалительных очагов;
• при лихорадке неясной причины возникновения;
• при менингите (воспалении оболочек головного или спинного мозга);
• при бактериурии (наличии бактерий в свежевыделенной моче);
• при полиорганной недостаточности (поражении многих органов, вызвавшем нарушение их функционирования);

- в хирургии:

• при инфекциях, возникших после оперативного вмешательства;
• при гнойных воспалениях почек и печени;
• при воспалительных процессах органов дыхательной системы;
• при воспалении внутренних половых органов;
• при инфекциях, возникших вследствие ожогов;
• при гангрене;
• при перитоните (воспалении париетального и висцерального листков брюшины);
• при синовите (скоплении жидкости в полости сустава);

- в гинекологии:

• при хроническом вагините (воспалении влагалища);
• при цистите (воспалении мочевого пузыря);
• при воспалительных процессах в матке и придатках;
• при кандидозе («молочнице»);

- в урологии и андрологии:

• при пиелонефрите (воспалительном процессе в почках, поражающем чаще всего их чашечно-лоханочную систему);
• при буллезном цистите (воспалении мочевого пузыря, сопровождаемом отеками слизистых оболочек);
• при уретрите (воспалении мочеиспускательного канала);
• при простатите (воспалении предстательной железы);
• при орхите (воспалении яичка);
• при гонорее;

- в репродуктологии:

• при бесплодии;
• при невынашивании беременности;
• при мужском и женском бесплодии, обусловленном инфекционными заболеваниями половых органов;
• при хронических воспалениях;

- в гастроэнтерологии:

• при синдроме раздраженного кишечника;
• при гастрите (воспалении оболочки желудка);
• при дисбактериозе (нарушении баланса микрофлоры);
• при диарее (поносе) или запоре;
• при болезни Крона (хроническом заболевании желудочно-кишечного тракта);

- в пульмонологии:

• при муковисцидозе (наследственном заболевании, характеризующемся поражением желез внешней секреции и нарушением функций органов дыхания);
• при пневмонии;
• при туберкулезе;
• при плеврите (патологическом состоянии дыхательной системы);
• при лихорадке неясного происхождения;

- в ЛОР:

• при гайморите (воспалении носовых гайморовых пазух);
• при синусите (воспалении слизистой оболочки околоносовых пазух);
• при фарингите (воспалении слизистой оболочки и лимфоидной ткани глотки);
• при отите (воспалении уха);

- в гепатологии:

• при асците (скоплении жидкости в брюшной полости);
• при дисбактериозе;
• при спонтанном бактериальном перитоните;

- в дерматовенерологии:

• при угревой болезни;
• при атопической экземе (кожной патологии, сопровождающейся характерным зудом, местными покраснениями и прочими отличительными свойствами);
• при себорее (патологическом состоянии кожи, обусловленном нарушением работы сальных желез);
• при онихомикозе (грибковой инфекции ногтевой пластинки или/и ногтевого ложа);
• при псориазе (хроническом неинфекционном кожном заболевании);
• при дерматитах (заболеваниях кожи), возникших по неясным причинам;
• при сифилисе.

Интерпретация исследования

Ответ выдается на бланке лаборатории медицинской компании "Наука". К нему прилагается выписка со списком исследуемых микроорганизмов, референсными значениями, величинами допустимых отклонений от нормы и сравнительной диаграммой (отклонение/норма). В выписке красным шрифтом отмечаются представители резидентной (постоянной) микрофлоры, синим шрифтом – транзиторной (временной). Также пациент получает дополнительную информацию, содержащую заключение и рекомендации по результатам проведенного исследования.

Результат теста выдается на бланке лаборатории медицинской компании «Наука». Пример анализа, в котором исследуемым биотопом является тонкая кишка, представлен ниже:

Ф.И.О.: Иванов Сидор Петрович           Пол: м                 Дата рождения: хх.хх.хххх

Дата исследования: хх.хх.хххх

Исследование	Результат	Нормы интерпретации	Примечание
Бактериология
[427] Хромато масс-спектрометрия микробных маркеров	См. выписку		Дата выдачи (дата исследования): хх.хх.хххх

Выписка:

№	анаэробы	Микроорганизм	Проба	Норма – средний арифметический показатель	Допустимый интервал отклонений от нормы*	Встречаемость в данном биотопе
Резидентные м.о. Определяются > 50% случаев			кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	%
1	Ан	Actinomyces spp	3	14	16	71
2	Ан	Actinomyces viscosus	969	670	259	97
3		Alcaligenes spp	117	60	40	86
4	Ан	Bifidobacterium spp.	3734	3203	2052	91
5	Ан	Clostridium coccoides	118	76	100	93
6	Ан	Clostridium perfringens	0	110	147	99
7	Ан	Clostridium propionicum	77	119	81	92
8	Ан	Clostridium ramosum	1975	1721	1033	97
9	Ан	Clostridium ramosum	237	438	290	100
10		Corineform CDC-group XX	71	79	56	99
11	Ан	Eggerthella lentа	483	273	221	100
12	Ан	Eubacterium spp.	6246	5743	3438	100
13	Ан	Fusobacterium/Haemophylus	0	5	4	81
14	Ан	Lactobacillus spp.	1021	1043	1030	97
15		Lactococcus spp.	0	563	498	99
16		Nocardia asteroides	335	1063	872	100
17	Ан	Prevotella spp.	0	28	16	100
18	Ан	Propionibacterium acnes	13	22	34	55
19	Ан	Propionibacterium freudenreichii	2591	1848	1147	100
20	Ан	Propionibacterium jensenii	0	50	69	54
21		Pseudonocardia spp.	0	17	24	66
22		Rhodococcus spp.	65	72	62	100
23	Ан	Ruminococcus spp.	765	460	264	100
24	Ан	Staphylococcus	374	464	175	100
25	Ан	Staphylococcus epidermidis	10	72	44	91
26	Ан	Streptococcus mutans (анаэробн)	270	182	103	100
27	Ан	Streptococcus spp.	0	138	152	81
28		Streptomyces spp.	133	90	101	67
Транзиторные м.о. Определяются < 50% случаев			кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	%
29		Bacillus cereus	0	2	2	15
30	Ан	Bacteroides fragilis	0	1	1	7
31	Ан	Bacteroides hypermegas	0	0	0	4
32	Ан	Campylobacter mucosalis	0	0	0	1
33	Ан	Clostridium difficile	0	0	0	4
34	Ан	Clostridium hystolyticum	0	7	5	17
35		Enterococcus spp.	0	4	3	17
36		Flavobacterium spp.	0	0	0	2
37	Ан	Helicobacter pylor	0	3	1	19
38		Kingella spp.	0	0	0	1
39		Acinetobacter spp.	0	0	0	1
40	Ан	Peptostreptococcus anaerobius 17642	0	0	0	4
41	Ан	Peptostreptococcus anaerobius 18623	0	14	11	11
42	Ан	Porphyromonas spp.	0	0	0	1
43	Ан	Prevotella ruminicola	0	1	4	9
44		Pseudomonas aeruginosa	0	0	0	1
45	Ан	сем. Enterobacteriaceae (E.coli и пр)	0	0	0	1
Микроскопические грибы			кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	кл/г х 10^5	%
46		Candida spp.	427	493	324	100
47		Aspergillus spp.	94	188	125	100
48		Micromycetes spp (кампестерол)	1124	795	554	99
49		Micromycetes spp (ситостерол)	1855	857	517	99
Вирусы**
50		Herpes simplex	1102	800	498	100
51		Вирус Эпштейна-Барр	0	260	391	53
52		Цитомегаловирус	0	384	695	41
В норме не встречаются
53		Bacillus megaterium	0	0	0	0
54		Chlamidia trachomatis	0	0	0	0
55		Mycobacterium spp.	0	0	0	0
56	Ан	Propionibacterium spp.	0	0	0	0
57		Stenotrophomonas maltophilia	0	0	0	0
58		Streptomyces farmamarensis	0	0	0	0

 

Соотношения результатов по сгруппированным м.о.

Микроорганизм	Нагрузка	Норма	% от ОБН
Резидентные	19600	19623	100.0
Транзиторные	0	33	0.0
В норме нет	0	0	0.0
Из них анаэробы	18878	17705	96.3
Общая бактериальная нагрузка (ОБН)	19600	19656
Микрогрибы	3501	2332
Вирусы	1102	1444
Плазмалоген (по 16а)	53.83	50	мкг/мл
Эндотоксин (сумма)	0.36	0,5	наномоль/мл

 

* Доверительный интервал – это пределы допустимых отклонений среднего арифметического показателя, т.е. интервал нормы. Избыток или недостаток микроорганизмов находится за пределами доверительного интервала.

** Отчет по вирусной нагрузке для удобства оценки ведется в условных компьютерных единицах и обозначает не количество вирусных тел, а маркерную (химическую) нагрузку.